故事舞臺為葦原町的“創圣學院”，學院分為兩個學部，一為明治時代以來的女校“創圣女學院”學部，俗稱“完美”；二為近年創立的男女校“創圣一般學部”，俗稱“細微”。前者是校風嚴肅的傳統名門學校，后者是自由度高、理念革新的學校，兩者幾乎相反。而男主角泉戶裕理則是屬于一般學部，并且是八衢神社宮司泉戶裕導的兒子，并有幾乎如親妹妹一樣的小鳥游由美奈義妹。 裕理與友人河合亞芽里和要三九郎一起度過升上三年級前的春假，當時學院正進行操場的擴充工程，其間發掘到刻有奇異文字的遺跡，其文字就是裕理家中神社所奉祀的神祇“太轉依”。但學院鑒定遺跡并無價值而繼續工..