人類進入大規模從事宇宙空間活動的宇宙世紀（Cosmic Era）后，主要在人工衛星上生活的調整者（Coordinator）與在地球生活的自然人（natural）的矛盾日益尖銳。在長期醞釀之后，由調整者殖民衛星組成了“P.L.A.N.T.”及其專門武裝軍事組織“Z.A.F.T.”（扎夫特），和以大西洋聯邦為首的地球聯合軍的對立日漸明顯。終于，在 C.E.70年2月11日，雙方放棄了所有的外交勢力，撕下臉皮開始了軍事行動，慘烈的宇宙戰爭自此爆發…